助力2023国自然选题 | TissueFAXS Cytometry全景组织流式定量分析技术

发表于:2023-02-24

国自然,国家自然科学基金,是20世纪80年代初,为推动我国科技体制改革,变革科研经费拨款方式,中国科学院89位院士学部委员致函党中央,国务院建议的。国家自然科学基金作为我国支持基础研究的主渠道之一,面向全国,重点资助具有良好研究条件、研究实力的高等院校和科研机构中的研究人员。

1月下旬,国家自然科学基金委发布通告:本年度项目集中接收工作于202331日开始,32016时截止。由此,2023年度国家自然科学基金进入提交前最关键的一个月。

在历年国自然资助的项目中,「肿瘤免疫」相关基金中标数逐年递增,热度未曾减退。而肿瘤微环境(tumor microenvironmentTME)又是[肿瘤免疫]中的重要研究方向。肿瘤微环境在肿瘤的发生、发展、转移以及药物敏感性方面扮演者重要角色。有关肿瘤微环境的研究,近几年的在Pubmed上的发文量逐年上升;过去10年国自然的中标项目,每年项目数量和资助金额都有所增长。


那么,针对国自然研究热点TG可以提供哪些解决方案呢?

肿瘤相关巨噬细胞白皮书

巨噬细胞是肿瘤微环境(TME)中最丰富的免疫细胞类型之一叭肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)起源千骨髓祖样,其表现出异质性,与肿瘤进展和肿瘤药物反应有关。 肿瘤将循环单核细胞和组织驻留巨噬细胞募集到TME,并将它们极化为M2巨噬细胞,再通过各种可溶性和机械因素产生TAM


单细胞表型分析

将 TissueFAXS获取的图像导入StrataQuest定量分析系统对图像进行单细胞分辨率数据分析。采用TG细胞核识别算法,对组织切片中单细胞进行统计分析,进一步通过细胞质算法获得panel中每个指标阳性阈值,以及分析不同指标之间的共表达情况,鉴定不同细胞亚群,如使用此panel可分析,肿瘤细胞,M1,M2型巨噬细胞等。

采用 TG细胞核识别算法,对组织切片中单细胞进行统计分析

空间表型分析

以肿瘤为中心细胞群体空间分布图。以肿瘤区域为中心,微米级别精度对微环境中免疫细胞的空间分布进行单细胞量化分析,不同颜色代表距离肿瘤的不同距离范围。右侧散点图中不同颜色点数表示距离肿瘤不同距离的免疫细胞浸润数量。


*完整版肿瘤相关巨噬细胞彩页请前点击阅读原文至TG学习中心。

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