1 Hepatology|中山大学附属第一医院匡铭教授团队揭示肝细胞癌射频消融后复发潜在机制

原文题目：Eliminating METTL1-mediated accumulation of PMN-MDSCs prevents hepatocellular carcinoma recurrence after radiofrequency ablation

发表期刊：Hepatology

阅读量：3634

对于多重免疫荧光染色的样本，文中均使用TissueFAXS多光谱成像系统(TissueGnostics, Austria)进行扫描。对成像结果使用了StrataQuest分析软件在单细胞水平上进行分析。在分析方法上，通过StrataQuest分析软件可以得到不同颜色通道的灰度图，在DAPI通道图像上应用核识别算法对单个细胞进行识别和圈定。然后，通过平均灰度值计算每个细胞每种不同Marker的表达量。绘制强度直方图和散点图，通过手动设置cut-off以及图像回溯功能得到每个Marker的阳性细胞数和阴性细胞数。

传统通过软件算法进行单细胞分析，只能进行原始的细胞核简单识别，细胞质、细胞膜等结构依赖于通过算法扩大细胞核轮廓，无法完成真实的细胞质形态学识别。TissueFAXS Cytometry技术不但可以针对每个荧光通道的细胞质形态进行圈选，还可以结合细胞核轮廓，实现单细胞的核/质/膜等亚细胞结构真实染色强度和形态的分析。

通过免疫组化和多重免疫荧光(mIF)染色，发现在RFA后复发的HCC中，METTL1表达增强，伴有CD11b+CD15+ PMN-MDSCs的增加和CD8+ T细胞的减少。

2 山东大学基础医学院马春红教授团队全新空间角度描绘Tim-3肿瘤免疫治疗策略新思路

原文题目：Spatial distribution and functional analysis define the action pathway of Tim-3/Tim-3 ligands in tumor development

发表期刊：Molecular Therapy

阅读量：1489

实验部分采用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra全景多光谱组织扫描定量分析系统肝细胞癌(HCC)组织芯片样本（TMA）进行多色荧光图像采集，并且通过StrataQuest定量分析软件对肿瘤组织和癌旁组织中不同类型的细胞数量比例，阳性率以及空间位置分布进行准确定量。

TMA 1（93例癌组织和87例癌旁组织，CD4，CD8，CD56，Tim-3）

TMA 2（100例癌组织和97例癌旁组织，CD3，CD4，HepPar-1，Tim-3，Tim-3 Fc）

3 JCI封面文章| 中山大学北京大学联合揭示口腔肿瘤免疫逃逸机制和新的治疗靶点

原文题目：TDO2+ myofibroblasts mediate immune suppression in malignant transformation of squamous cell carcinoma

发表期刊：Journal of Clinical Investigation

阅读量：1262

使用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra全景多光谱组织扫描定量分析系统获取图像。获取到图像利用StrataQuest软件进行定量分析。应用TissueFAXS Cytometry技术，研究者通过免疫荧光证实TDO2仅表达于癌组织的a-SMA+肌成纤维细胞中，并且通过多色免疫组化（mIHC）染色证明：

1. TDO2+肌成纤维细胞(TDO2+α-SMA+)、TDO2-肌成纤维细胞(TDO2-α-SMA+)和癌细胞(Pan-CK+)及癌巢近端/远端的空间定位关系。

2. CD4+和CD8+T细胞在TDO2+和TDO2-肌成纤维细胞周围分布的关系。

3. TDO2+和TDO2-肌成纤维细胞(半径<50μm)周围Foxp3+CD4+T细胞的空间分布比例关系。

4. TDO2+肌成纤维细胞周围PD-1+TIM-3+CD8+T细胞的空间分布关系。

5. TDO2+或TDO2-肌成纤维细胞在癌巢边界近端和远端的空间分布。

6.未治疗组与TDO2i组小鼠癌巢边界近端100um区域内，Foxp3+CD4+1043T细胞的空间分布及比例。

7. 未处理组和TDO2i组之间，TIM-3+CD8+T细胞和GZMB+CD8+T细胞在癌巢边界近端100um区域内的空间分布及比例。

4 STTT重磅| 南京大学团队揭示肿瘤“善变”的巨噬细胞在塑造微环境的发生机制

原文题目：Intervening pyruvate carboxylase stunts tumor growth by strengthening anti-tumor actions of tumor-associated macrophages

发表期刊：Signal Transduction and Targeted Therapy

阅读量：1145

首先，作者通过免疫荧光技术分析了69块黑色素瘤和14块正常组织（TMA样本）PCB的表达情况，利用TissueGnostic公司TissueFAXS扫描系统对TMA样本进行图像采集，并使用TissueGnostic公司专业级组织原位定量分析系统StrataQuest对PCB的表达准确定量，结果显示在黑色素瘤患者中TAMs中的PCB表达量显著下降。

随后，考虑到缺氧是实体肿瘤的一个关键特征，同样，通过通过免疫荧光技术，使用TissueFAXS扫描系统对小鼠肿瘤切片进行扫描成像，StrataQuest定量分析发现位于HIF-α高表达区域的TAMs的PCB丰度低于位于HIF-α低表达区域的TAMs。

机制方面，文章表明PCB能够促进肌球蛋白MYH6与F-actin的结合而重塑巨噬细胞骨架，驱动TAMs对肿瘤细胞的吞噬。通过构建递氧/激活PCB的双功能纳米颗粒FDC-GTA@HSA，同时改善乏氧并激活PCB，抑制细胞IRF1-PD-L1轴，增强了微环境中CD8+ T细胞的浸润，逆转微环境免疫抑制状态。此研究结果不仅发现PCB 的非经典生物学功能与调控新机制，而且构建了“靶向干预TAMs极化”的专利技术，可用于进一步免疫治疗新策略构建。

5 Nature Communications| 华中科技大学提出改善光热疗法在肿瘤治疗中的新策略

原文题目：Reversing insufficient photothermal therapy-induced tumor relapse and metastasis by regulating cancer-associated fibroblasts

发表期刊：Nature Communications

阅读量：1140

文中使用了StrataQuest分析软件(TissueGnostics)进行数据分析，结果通过散点图或直方图展示，并可以通过回溯功能验证结果的准确性。StrataQuest分析软件不仅可以在单细胞水平上定量分析肿瘤不同标记物的阳性水平，也可以在空间范围内分析不同标记阳性细胞间的距离关系，揭示不同细胞在组织内的分布关系。

6 南京大学沈萍萍教授团队揭示PPARγ翻译后修饰调控细胞代谢重编程的新机制

原文题目：Blockage of PPARγ T166 phosphorylation enhances the inducibility of beige adipocytes and improves metabolic dysfunctions

发表期刊：Cell Death & Differentiation

阅读量：908

在本研究中，为了能够系统地评估PPARγ T166磷酸化调控的脂肪组织米色化的效能，研究团队运用了TissueGnostic公司的TissueFAXS扫描系统对小鼠整块皮下脂肪组织的最大纵向横截面进行了全景定量分析与精确地数据采集，全面获取了脂肪细胞大小、脂滴尺寸、脂滴形态等信息。

并通过TissueGnostic公司专业级组织原位定量分析系统StrataQuest对获取到的数据信息进行进一步的统计分析，发现PPARγ T166磷酸化可阻碍脂肪细胞内脂滴多室化，促进1000-1000μm2的大脂滴的形成，而干预PPARγ T166磷酸化可逆转此过程。

此外，通过运用该系统，研究团队还对PPARγ T166磷酸化位点的点突变小鼠脂肪细胞内脂质含量进行了评估，并发现PPARγ T166磷酸化可介导脂肪细胞内的脂质堆积。

7 Nature Communications| 蛋白磷酸酶2A（PP2A）或将成为肿瘤生物标志物“新宠”

原文题目：Protein phosphatase 2A inactivation induces microsatellite instability, neoantigen production and immune response

发表期刊：Nature Communication

阅读量：891

作者利用TissueGnostic公司的TissueFAXS扫描成像系统分别对类器官培养样本，小鼠原发结肠癌组织以及人类结肠癌组织三种不同的免疫组化样本进行成像，发现无论是类器官培养样本还是小鼠原发结肠癌组织样本，PP2A的失活都导致错配修复蛋白MLH1蛋白水平降低。

在对人类MSS和MSI型结肠癌免疫组化样本分析时，再次利用TissueGnostics公司单细胞定量分析软件HistoQuest对PP2A内源性抑制物，CIP2A和SET以及PP2A本身的蛋白表达水平进行了准确的定量，并以蛋白的阳性率的数值对表达水平进行了分级，HistoQuest为组织原位单细胞的定量数据提供了强有力的支持。

8 Science子刊|TissueFAXS Cytometery技术&新型细胞因子疗法为肿瘤免疫治疗带来希望

原文题目：Lack of CD8+ T cell effector differentiation during priming mediates checkpoint blockade resistance in non–small cell lung cancer

发表期刊：Science Immunology

阅读量：722

实验部分采用TissueGnostics公司TissueFAXS 全景组织流式定量分析系统对侧腹部肿瘤组织样本和肺部肿瘤组织样本进行全景图像采集，并且通过TissueQuest定量分析软件不同肿瘤中肿瘤生长面积与组织占比进行准确定量，发现肺部肿瘤组织样本能够抵抗ICB治疗，而侧腹部肿瘤组织样本中肿瘤明显减小。

同时，通过对肿瘤区域的肿瘤浸润淋巴细胞 (TIL) 进行免疫荧光染色，准确定量TILs密度发现侧腹部肿瘤组织样本和肺部肿瘤组织样本（CD8，Pan-Cytokeratin，PI）中均存在TILs,但是在ICB治疗后，侧腹部肿瘤组织中TILs数量明显增加。

9 中山大学附属第三医院高压氧联合抗肿瘤药物增强PD-1抗体对肝癌细胞的作用

原文题目：Hyperbaric oxygen facilitates teniposide-induced cGAS-STING activation to enhance the antitumor efficacy of PD-1 antibody in HCC

发表期刊：Journal for ImmunoTherapy Cancer

阅读量：680

为了最大限度地激活肝细胞癌，中山大学附属第三医院肝脏外科暨肝脏移植中心杨扬教授团队结合了替尼泊苷和HBO疗法。安全地刺激了免疫原性、T细胞炎症的肝癌TME，导致肿瘤对抗PD-1免疫疗法进一步增敏。并且尝试通过有效的肿瘤复氧增强DNA激活的STING信号来提高肝癌患者对PD-1抗体的应答率。这些发现都可能为晚期肝癌的治疗提供有效的方法。

使用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra SL高通量全景多光谱组织扫描定量分析系统获取多色免疫组化肝癌样本（P-IRF3，CD11c，CD3，CD8和DAPI）图像。

10 TissueFAXS Cytometry技术再助力MIT团队在新冠肺炎T细胞亚群研究的新发现

原文题目：Temporal changes in T cell subsets and expansion of cytotoxic CD4+ T cells in the lungs in severe COVID-19

发表期刊：Clinical Immunology

阅读量：570

首先作者对重症COVID-19患者肺部的CD8+ T细胞浸润进行多色荧光染色，利用TissueGnostics公司的TissueFAXS扫描系统对组织切片进行拍摄，并同时利用TissueQuest定量分析系统对不同患者样本的免疫细胞数量及占比进行精确定量。

随后，作者对引流淋巴结同样进行切片染色分析，使用TissueQuest定量发现在晚期COVID-19患者体内表现出CD4+ T细胞淋巴细胞减少和CD4+ CTL表型细胞增加。大多数CD4+ T细胞淋巴细胞减少可能与淋巴结中CXCR5 + CD4+ TFH细胞的丢失有关。

最后，基于CD4 + CTLs细胞亚群的增加，进一步对HLA-DR以及cCasp3等表达进行分析，结果显示CD4 + CTLs细胞在晚期内流和病毒的清除可能与感染细胞凋亡死亡的增加有关。更有意思的是，巨噬细胞浸润作为COVID-19的一个特征，同样在晚期有很高比例的浸润。