2021 年 10 月发表在 Sci Immunol 的一篇论文中研究了非小细胞肺癌（NSCL）微环境，研究发现肿瘤中的 CD8+ T 细胞未能上调免疫检查点阻断（ICB）的效应分子，从而未能阻止肿瘤的发展。该研究有助于合理开发针对 T 细胞浸润的新治疗策略[3]。单细胞测序和多色荧光技术在此研究中起到了很好的助力。

传统的转录组测序是基于对整块组织的检测，得到的是成千上万个细胞的平均值，其结果仅代表微环境中细胞的平均水平。而单细胞测序将测序的分辨率提升到单细胞水平，可以反应细胞间的异质性，解析细胞间更细微的差异，有效地揭示单个细胞的状态和功能。运用单细胞测序来研究 TME 便成为了有效的研究方法，在探究机制的同时辅助临床找到有效对抗某些肿瘤的靶向药物，从而达到缓解病痛甚至治愈的效果[4-7]。

单细胞测序研究肿瘤微环境[8]

单细胞测序技术完成了细胞水平的组学研究，但是获取的信息内缺失了细胞的空间分布信息。如果想要补充细胞的空间位置表型，就需要引入多重免疫荧光（mIF）技术。mIF 通过单细胞分辨率的组织成像，能够多靶点、可视化地描绘细胞的复杂空间位置信息，从而揭示细胞间的相互作用关系，细化微环境的空间结构。目前，基于mIF 技术的空间表型特征正在用以开发新一代生物标志物，在对 PD-1/PD-L1 免疫治疗产生反应方面，mIF 基于下一代测序的肿瘤突变负荷和基因表达谱具有较高的预测价值[9]。

组织多色空间表型分析肿瘤微环境（图片来源：TG）

因此，单细胞测序技术与多重免疫荧光技术的结合能够多层次、多角度、多组学地研究肿瘤微环境及免疫微环境，同时获悉胞间联系、基因空间变化等信息，并赋予关键基因的细胞分布信息和组织分布信息，从而更加精准地研究疾病相关分子机制并探索潜在的治疗靶点。

针对以上两种技术的结合应用，4 月 7 日 14:00-15:20，丁香园携手新格元和 TG 将开展「单细胞测序联合组织原位蛋白定量多组学分析应用分享」线上直播。本次特别邀请到了新格元技术支持主管张静博士和 TissueGnostics 公司高级应用专家龚小东博士，为大家进行在线解读。